Gelapp: DNA&Prot Gel Analyzer

Aplikasi android 1 untuk menganalisis gel (agarose dan PAGE) band dengan log skala

* Sejalan dengan perubahan OS Android, silakan akses file lokal menggunakan ES File Explorer, yang akan membasmi drive / kartu SD. Anda harus masuk ke ES File Explorer untuk melakukan rooting terlebih dahulu. Harap perhatikan bahwa dukungan Dropbox dihapus karena perubahan di Android dan Dropbox.

Ini adalah aplikasi android pertama yang memungkinkan Anda untuk menganalisis band gel (baik agarose dan PAGE) dengan grafik log yang dihasilkan secara otomatis dari penanda. Ini memungkinkan deteksi dan pemuatan otomatis untuk penggunaan di masa mendatang. Memanfaatkan filter Gabor, aplikasi ini memungkinkan pengguna untuk meningkatkan pendeteksian band secara otomatis. Untuk gambar berkualitas buruk, pengguna dapat mengklik secara manual dapat menggambar kotak pada band yang diinginkan atau klik pada gambar untuk menentukan lokasi yang ditentukan.

Gambar dapat dimuat dari galeri atau dropbox, membuatnya sangat nyaman. Gambar terbaik adalah gambar yang dihasilkan melalui pemindai, tetapi berfungsi dengan foto yang diambil dengan baik dari kamera ponsel.

Foto harus diambil pada bidang langsung dengan gel.

Fitur aplikasi ini termasuk:

1) Spesifikasi agarose atau HALAMAN.

2) Identifikasi warna pita penanda untuk PAGE.

3) filter pencitraan canggih - Garbor.

4) Pengolahan gambar otomatis dengan input pengguna yang disesuaikan jika diperlukan.

5) Menyimpan pengaturan untuk pemrosesan gambar untuk kenyamanan di masa mendatang.

6) Menyimpan penanda untuk kenyamanan di masa mendatang ketika menggunakan spidol yang sama.

7) Antarmuka pengguna yang sederhana dan berbasis tombol.

8) Deteksi otomatis band.

9) Kotak batas sederhana yang ditentukan pengguna.

10) Grafik log penanda secara otomatis dihasilkan.

11) Lokasi yang ditentukan pengguna untuk band-band tertentu.

12) Kompatibilitas dengan tampilan lansekap dan potret dari berbagai tablet dan smartphone berukuran ganda.

13) Kompatibilitas dengan fungsi screenshot gel yang dianalisis dan log grafik smartphone dan tablet untuk publikasi atau laporan.

14) Pembacaan ditampilkan dalam gambar gel dengan kotak yang disorot dan ukuran band yang dihitung.

15) Fungsi pemangkasan untuk gambar sebelum analisis.

16) Edit fungsi untuk menghilangkan pita yang tidak diinginkan.

17) Kotak berwarna berbeda untuk penanda dan pita.

18) Akses langsung yang mudah ke Galeri gambar untuk gambar.

19) Kompatibel dengan Sybr Green, analisis gel agarose EtBr.

20) Akses kamera langsung.

Manfaat menggunakan aplikasi ini untuk publikasi

1) Membawa keakuratan yang lebih besar untuk analisis gel Anda daripada mengandalkan perkiraan.

2) Nilai menambah publikasi dan laporan.

3) Alat pengajaran yang berguna untuk siswa sains.

4) Analisis yang efisien, mengurangi kesalahan manusia dan subjektivitas - Anda sekarang dapat mempercayai nilai-nilai yang dilaporkan oleh peserta pelatihan dan staf yang kurang berpengalaman!

5) Pada analisis go dengan smartphone / tablet.

6) Analisis otomatis - tidak perlu kertas grafik dan ploting yang membosankan.

7) Aplikasi ini GRATIS!

8) Aplikasi ini berdiri sendiri, tidak perlu akses internet (kecuali untuk analisis dropbox).

Pengguna Android 6 bisa mendapatkan gambar dari galeri "Gambar" lokal. Pengguna versi Android sebelumnya akan memiliki dukungan untuk DropBox. Ini karena perubahan di Android 6, dan berada di luar kendali kami.

Untuk petunjuk penggunaan, silakan tonton video di https://www.youtube.com/watch?v=Chlzhy8d_KA&feature=youtu.be

Userguide tersedia sebagai pdf di http://tinyurl.com/GelApp

* Ponsel terbaru mis. Samsung Note 8 mungkin memiliki masalah dengan penghematan kamera. Jika ada masalah seperti itu, jangan gunakan galeri.

Untuk mengutip, silakan gunakan:

Sim, JZ. *, Nguyen, PV. *, Lee, HK., Gan, SKE. (2015). GelApp: Analisis elektroforesis gel mobile. Catatan Aplikasi Metode Alam. doi: 10.1038 / an9643

ATAU ke perangkat lunak langsung di App store

Sim, J.Z., Nguyen, P.V., Gan, S.K.E. (2014) GelApp: DNA & Prot Gel Analyzer v1.2. [Perangkat Lunak Aplikasi Seluler]. Diperoleh dari https://play.google.com

Aplikasi ini adalah produk dari Lab Antibodi & Pengembangan Produk, Divisi Penelitian Translasional, Bioinformatics Institute, Badan Sains, Teknologi, dan Penelitian, Singapura.

Kreatornya adalah: Mr SIM Jia Zhi, Mr NGUYEN Phi Vu, dan Dr Samuel GAN.

                    (Poli magang) (Petugas Peneliti) (Asisten Peneliti Utama)